以下のようにMPEG ts（トランスポートストリーム）ファイルを結合するだけで結合できると思います。
$ cat file1.m2ts file2.m2ts file3.m2ts > output.m2ts
しかし、 前述のcatでの結合は一般的に機能しますが、タイムコードの問題により、一部のメディアプレーヤーで問題が発生する可能性があります。
そのため、次のようにffmpegを使った方が良いです。
$ ffmpeg -i "concat:file1.m2ts|file2.m2ts|file3.m2ts" -c copy output.m2ts